Nie no Hakoniwa conta a história de Yasaka Kurou, um rapaz de fora da vila que é adotado pela família mais rica, os nobres Shiki. A sua missão é se casar com a filha mais velha deles, Shiki Kyouko, porém no dia em que o matrimônio deveria ocorrer, eventos misteriosos levam ao nascimento de um grande pesadelo.
Com elementos de mistério e terror, a obra gira em torno de uma misteriosa caixa que um dia foi trazida por uma pessoa de fora da vila, causando uma revolução na hierarquia. Depois disso, foram criadas sete famílias nobres com os moradores que antes eram explorados pelos então-líderes.
